מערכת החיסון אחראית על הגנה על הגוף מפני פלישה על ידי מחלות ופתוגנים אחרים כולל נגיפים, חיידקים וטפילים. מערכת החיסון מעורבת גם בתגובת הריפוי הרגילה לטראומה כהגנה מפני זיהום. אף על פי שהגוף הוא שלם משולב וכל המערכות פועלות יחד במידה מסוימת, מערכות הגוף העיקריות העובדות עם מערכת החיסון הן לימפה, מחזור הדם, מערכת השלד והעיכול.
תימוס
התימוס הוא איבר מיוחד והוא חלק ממערכת החיסון. התימוס נמצא מתחת לסטרנום ופעיל רק בקרב צעירים. ניתן לחשוב עליו כשטח ההדרכה החיסוני לגוף הבוגר בו תאי החיסון לומדים להבדיל בין פתוגנים לבין עצמי.
מערכת הלימפה
זה דרך מערכת הלימפה שהגוף מעביר נוזלים מחוץ לדם ולמחזור הדם. הלימפה היא המסלול העיקרי להפצת תאי חיסון ואותות חיסוניים. הוא מכיל אלפי בלוטות לימפה בהן תאי החיסון מדגימים ומגיבים לפתוגנים פולשים. שקדים, התוספתן ורקמות הלימפה הקשורות במעיים (GALT) דומים לבלוטות הלימפה והם איברים מיוחדים יותר שהגוף משתמש בהם כדי לפתח ולמתן תגובות חיסוניות.
מערכת דם
מערכת הדם מורכבת מכלי הדם והלב ומהווה מסלול מרכזי המשמש את תאי החיסון לצורך נסיעה בגוף.
מערכת השלד והשרירים
באמצעות תנועת השרירים מועבר הלימפה בכל הגוף. זו אחת הסיבות העיקריות לכך שפעילות גופנית קבועה היא קריטית לתפקוד חיסוני בריא. מח העצמות הארוכות והשטוחות בגוף הוא המקום בו תאי הדם, כולל תאי החיסון, גדלים ומתבגרים לפני הכניסה למערכת הדם והלימפה.
מערכת עיכול
מערכת העיכול היא קריטית לתפקוד חיסוני תקין. ה- GALT, כולל השקדים והתוספתן, הם מקומות בהם הגוף מפענח אילו חומרים זרים הם מזון ואילו הם פתוגנים, ומסייע ביצירת תפקוד חיסוני תקין.
מערכות אחרות
יחד עם ארבע המערכות העיקריות, מערכות הנשימה, העצבים והאנדוקריניות מעורבות מאוד בתפקוד החיסוני. הריאות מעורבות באופן אינטגרלי בחשיפה של מערכת החיסון לפתוגנים ובדומה למערכת העיכול יש כמויות גדולות של רקמות חיסוניות. מערכות העצבים והאנדוקריניות חולקות רבים מאותם כימיקלים איתותים כמו מערכת החיסון ויחד עם מערכת החיסון חיוניים לאיזון הגוף וההומאוסטזיס (יכולת לשמור על שיווי משקל פנימי).