פטריות שייכות לממלכת הפונגי, חיידקים למונרה ומפגינים לפרוטיסטה. למרות שלעתים קרובות נחשבים לאורגניזמים כגורמים מזיקים לבריאות האדם, רבים מהם קיימים למעשה במזונות שאתה נהנה מהם, כמו גם בגוף עצמו. עם זאת, הגוף מצויד לשמור על איזון בריא של חיידקים ופטריות כאחד.
לחם
לחם סחוט מכיל שמרים המהווים פטריה נפוצה הן בגוף ומחוצה לו, וכן אורגניזם יעיל להעלאת הלחם. שמרים מתפקדים על ידי מטבוליזם של הסוכרים הפשוטים של הבצק. תוצר הלוואי של הפעילות המטבולית הוא פחמן דו חמצני ואלכוהול, מה שבתורו גורם ללחם להתפחה. תהליך תסיסה זה מחזק ומפתח גם את הגלוטן הקיים בבצק, ובנוסף הוא תורם את טעם הלחם.
יוגורט
יוגורט רגיל הוא אחד המוצרים הבריאים ביותר שתוכלו לצרוך, על פי מרפאת מאיו. לרוב מתווספים לו פרוביוטיקה, הפועלים כחיידקים "טובים", המסייעים לשמירה על האיזון בין עמיתיהם ה"רעים ". סוגי החיידקים הנפוצים בתוך יוגורט כוללים Lactobacillus delbrueckii, Streptococcus thermophilus ו- Bifidiobacterium. כל זן מסוגל לשרוד בתוך מעי העיכול המסייע בעיכול לשיפור הסדירות. מכוני הבריאות הלאומיים אומרים כי הישרדות זו היא המפתח לתפקיד הפרוביוטיקה ומשפר משמעותית את העיכול אצל אלו הצורכים בדרך כלל יוגורט.
מיסו
מיסו מכיל פטריות וגם חיידקים. על פי המחלקה לבוטניקה מאוניברסיטת הוואי, ייצור מיסו מחייב שימוש בפטרת Aspergillus oryzae הדוגרת בתוך המיסו במהלך התסיסה. האיגוד למחקר אסיאתי אומר כי מיסו מכיל חיידקים מסונתזים B12, שאוכלים חומצה לקטית, ואנזימים המסייעים בעיכול ובספיגת המזון.
אצות ים
אצות ים הן מגן רב-תאי ונחשב לאצות חומות, כך מדווחת אוניברסיטת קולינמו קולמונט באוניברסיטת סינסינטי. אצות ים הן מקור מצוין ליוד, הכרחי לבלוטת התריס המתפקדת כראוי. אצה Porphyra umbilicalis היא פריט מזון עיקרי ביפן, הנקרא נורי או מכבסה סגולה, המופק על ידי ייבוש האצות והמלחתו קלות. ארגון המזון והחקלאות של האו"ם אומר כי נורי זה הוא הצורה המזינה ביותר של אצות, עם אחוז חלבון של 30 עד 50 אחוזים.